一、软件介绍：

GSEA是一种计算方法，用于确定先验的定义的一组基因以统计学方式显示两种生物状态之间显著的、一致的差异。

开发语言：Java

源码地址：https://data.broadinstitute.org/gsea-msigdb/gsea/software/desktop/4.3/GSEA_4.3.2.zip

二、安装步骤：

1、依赖安装：

yum install java-11-openjdk-devel.aarch64

2、可视化组件安装：

yum install xorg-x11-xauth xorg-x11-server-utils xorg-x11-server-Xnest libXtst

sed -i "s/X11Forwarding no/X11Forwarding yes/g" /etc/ssh/sshd_config

systemctl restart sshd.service

3、GSEA安装：

cd /path/to/GSEA

wget https://data.broadinstitute.org/gsea-msigdb/gsea/software/desktop/4.3/GSEA_4.3.2.zip

unzip GSEA_4.3.2.zip

三、软件验证：

cd /path/to/GSEA/GSEA_4.3.2

java --module-path=modules -Xmx4g @gsea.args --patch-module=jide.common=lib/jide-components-3.7.4.jar:lib/jide-dock-3.7.4.jar:lib/jide-grids-3.7.4.jar --module=org.gsea_msigdb.gsea/xapps.gsea.GSEA