一、软件介绍：

pangolin：用于将 SARS-CoV-2 基因组序列分配给全球谱系的软件包

开发语言：Python

源码地址：https://github.com/cov-lineages/pangolin/archive/refs/tags/v4.3.1.tar.gz

二、安装步骤：

1、依赖安装：

yum install python3-devel python3 python3-pip git make

pip install --upgrade pip

2、pangolin安装：

cd /path/to/pangolin

wget https://github.com/cov-lineages/pangolin/archive/refs/tags/v4.3.1.tar.gz

tar xf v4.3.1.tar.gz

cd pangolin-4.3.1

pip install .

pip install git+https://github.com/cov-lineages/pangolin-data.git

pip install git+https://github.com/cov-lineages/scorpio.git

pip install git+https://github.com/cov-lineages/constellations.git

pip install snakemake

三、软件验证：

pangolin -h