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鲲鹏环境openEuler20.03安装生信软件flair
鲲鹏环境openEuler20.03安装生信软件flair
发表于2023/11/24
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一、软件介绍:

flair(RNA 的全长替代异构体分析)用于噪声读取的校正、异构体定义和选择性剪接分析。flair主要用于纳米孔 cDNA、天然 RNA 和 PacBio 测序读取。

开发语言:Python

源码地址:https://github.com/BrooksLabUCSC/flair/archive/refs/tags/2.0.0.tar.gz

二、安装步骤:

1、依赖安装:

yum install python3 python3-devel python3-pip bzip2-devel xz-devel

pip3 install numpy tqdm ncls pybedtools mappy==2.24 pysam scip

2、flair安装:

cd /path/to/flair

wget https://github.com/BrooksLabUCSC/flair/archive/refs/tags/2.0.0.tar.gz

tar xf 2.0.0.tar.gz

cd flair-2.0.0

export PATH=`pwd`/bin:`pwd`/src/flair:$PATH

三、软件验证:

flair --version

cke_6634.png

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