一、软件介绍：

acedb是一个基因组数据库系统，它提供了自定义数据库内核，设计了非标准数据模型，特别用来处理科学数据，尤其是基因组数据，目前在基因组项目管理领域有广泛应用。

开发语言：C/C++

源码地址：http://deb.debian.org/debian/pool/main/a/acedb/acedb_4.9.39+dfsg.02.orig.tar.xz

二、安装步骤：

1、依赖安装：

yum install wget tar gcc gcc-c++ libX11-devel libXmu-devel flex-devel flex gtk2-devel rpcgen tcsh glib2-devel readline-devel byacc

2、acedb安装：

cd /path/to/acedb

wget http://deb.debian.org/debian/pool/main/a/acedb/acedb_4.9.39+dfsg.02.orig.tar.xz

tar xf acedb_4.9.39+dfsg.02.orig.tar.xz

export ACEDB_MACHINE=LINUX_64

sed -i "s/GSettings/GSettings1/g" ./w9/blxview.c

sed -i "31s/$/ -lX11/" ./wmake/LINUX_64_DEF

make

三、软件验证：

cd /path/to/acedb/bin.LINUX_64

./acediff --help

./acediffsorted --help

./belvu

四、故障排查：

1、freeout.c:37:10: fatal error: glib.h: No such file or directory

解决方案：yum install tcsh gtk2-devel

2、acein.c:48:10: fatal error: readline/readline.h: No such file or directory 

解决方案：yum install readline-devel

3、make[1]: rpcgen: Command not found

解决方案：yum install rpcgen

4、make[1]: flex: Command not found

解决方案：yum install flex flex-devel

5、make[1]: yacc: Command not found

解决方案：yum install byacc

6、blxview.c:3450:13: error: ‘GSettings’ redeclared as different kind of symbol

blxview.c中的GSettings与系统/usr/include/glib-2.0/gio/giotypes.h的GSettings重复，修改blxview.c中的GSettings的命名

解决方案：sed -i "s/GSettings/GSettings1/g" ./w9/blxview.c

7、/usr/bin/ld: ./libgex.a(graphgdkremote.o): undefined reference to symbol 'XFree' 

/usr/bin/ld: /usr/lib64/libX11.so.6: error adding symbols: DSO missing from command line 

经定位分析，符号XFree在libX11的动态库中

解决方案：yum install libX11-devel，同时在配置文件中链接上X11动态库

sed -i "31s/$/ -lX11/" ./wmake/LINUX_64_DEF

8、xremotemain.c:51:10: fatal error: X11/Xmu/WinUtil.h: No such file or directory

解决方案：yum install libXmu-devel