1、移植环境

2、禁用nouveau驱动

1）、执行以下命令查看nouveau驱动是否已禁用

lsmod |grep nouveau

2）、执行以下命令禁用nouveau驱动

新建文件/etc/modprobe.d/disable-nouveau.conf

添加如下两行：

blacklist nouveau

options nouveau modeset=0

3）、备份并生成新的initramfs文件

cp /boot/initramfs-$(uname -r).img /boot/initramfs-$(uname -r)-nouveau.img

dracut -f /boot/initramfs-$(uname -r).img $(uname -r)

4）、重启机器

reboot

3、安装NVIDIA-CUDA组件

1）、执行以下命令确认nouveau驱动已禁用（回显为空）

lsmod |grep nouveau

2）、执行以下命令安装NVIDIA-CUDA组件：

wget https://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/11.4.0/local_installers/cuda_11.4.0_470.42.01_linux_sbsa.run

sudo sh cuda_11.4.0_470.42.01_linux_sbsa.run

3）、配置环境变量：

export PATH=/usr/local/cuda-11.2/bin:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-11.2/lib64:$LD_LIBRARY_PATH

4）、执行以下命令验证

nvcc –v

4、源码编译安装vmd

1）、 获取vmd源码包

软件版本为：vmd-1.9.4a55.src.tar.gz

https://www.ks.uiuc.edu/Development/Download/download.cgi?PackageName=VMD

新建文件夹 mkdir /Projects/vmd

上传vmd-1.9.4a55.src.tar.gz到/Projects/vmd，然后解压得到plugins和vmd-1.9.4a55

2）安装依赖

（1）、fltk

系统自带，如果系统未安装，使用yum install fltk fltk-devel安装，也可参考/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/fltk中README说明安装

（2）、actc

下载actc源码actc-1.1.tar.g，http://plunk.org/~grantham/public/actc/

解压到/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/actc中，并直接make进行编译，
如果有libactc.a出现则算是编译成功了。需要额外信息请查看README。

（3）、stride

下载stride源码stride.tar.gz，http://webclu.bio.wzw.tum.de/stride/

解压到/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/stride中，make编译得到二进制stride，然后为stride 添加软链接/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/stride/stride_LINUXARM64

（4）、surf

/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/surf目录下有源码包surf.tat.Z，安装依赖yum install opencv-contrib，make编译得到surf，

为surf添加软链接/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/surf/surf_LINUXARM64

（5）、vrpn

下载vrpn源码vrpn-master.zip， https://github.com/vrpn/vrpn，

解压到/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/vrpn，使用cmake编译。

cd /Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/vrpn/

mkdir build

cd build

cmake ../ -DCMAKE_INSTAL_PREFIX=/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/vrpn/

make && make install

（6）、tachyon

下载tachyon源码tachyon-0.99b6.tar.gz，
https://ftp.sudhip.com/archlinux/other/community/tachyon/tachyon-0.99b6.tar.gz

将tachyon-0.99b6.tar.gz解压到/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/tachyon，

cd /Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/tachyon/

cd unix

编辑Make-config，将支持JPEG和PNG部分全部注释掉，因为Tachyon 0.99 beta 6的bug问题，使得支持JPEG和PNG文件读写在最后编译vmd时候报错

cd ../demosrc

修改spaceball.c第35行，将port改为serialport。

修改109行的括号，源码漏掉几个括号

cd ../unix

vim Make-arch，去掉-m64编译参数

make linux-64-thr

cd ../compile/linux-64-thr，为tachyon添加软链接

/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/tachyon/tachyon_LINUXARM64

（7）、tck、tk

安装tcl/tk 8.5版本rpm包，或者挂载centos7.6的镜像源，yum安装

3） 、编译plugins

cd /Projects/vmd/plugins

设置tcl头文件和库文件环境变量

export TCL_INCLUDE_DIR=/usr/share/tcl8.5

export TCL_LIBRARY_DIR=/usr/lib64/tcl8.5

make LINUXARM64

mkdir /Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/plugins

export PLUGINDIR= mkdir /Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/plugins

make distrib

4）、编译VMD

cd /Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/

编译configure文件

设置安装路径信息

$install_bin_dir="/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/bin";

$install_library_dir="/Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/lib/vmd";

设置tachyon环境变量

$libtachyon_dir="/Project/vmd/vmd-1.9.4a55/lib/tachyon/tachyon";

$libtachyon_include="-I/Project/vmd/vmd-1.9.4a55/lib/tachyon/tachyon/src";

$libtachyon_library="-L"/Project/vmd/vmd-1.9.4a55/lib/tachyon/tachyon/compile/linux-64-thr;

修改LINUXARM64的$arch_nvccflags参数

注释掉"-gencode arch=compute_30,code=compute_30 " . （约2634行）

编译

./configure LINUXARM64 EGLPBUFFER CUDA IMD LIBTACHYON ZLIB COLVARS TCL PTHREADS SILENT

cd src && make veryclean

make

如果出现“No resource compiler required on this platform”，说明编译顺利，然后安装

make install

当看到"Make sure /Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/bin is in your path.

VMD installation complete.  Enjoy!"说明安装成功。

5）、  验证

cd /Projects/vmd/ vmd-1.9.4a55/bin

./vmd