一、软件介绍：

cuteSV：一种灵敏、快速且可扩展的基于长读的SV检测方法。CuteSV采用量身定制的方法来收集各类SV的特征码，并采用聚类和细化的方法对特征码进行分析，实现灵敏的SV检测。对真实 Pacific Biosciences (PacBio) 和 Oxford Nanopore Technology (ONT) 数据集的基准测试表明，cuteSV 比最先进的工具具有更好的产量和可扩展性。

开发语言：Python

源码地址：https://github.com/tjiangHIT/cuteSV/archive/refs/tags/cuteSV-v2.0.3.tar.gz

二、安装步骤：

1、依赖安装：

cd /home

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2023.07-2-Linux-aarch64.sh --no-ch

bash Anaconda3-2023.07-2-Linux-aarch64.sh

按照提示输入"yes"，将安装路径设"/home/anaconda3"，进行下一步安装。

source /home/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh

conda create -n cuteSV

conda activate cuteSV

conda install python==3.9.9 -c conda-forge

pip3 install setuptools==57.5.0

2、cuteSV安装：

cd /path/to/cuteSV

wget https://github.com/tjiangHIT/cuteSV/archive/refs/tags/cuteSV-v2.0.3.tar.gz

tar xf cuteSV-v2.0.3.tar.gz

cd cuteSV-cuteSV-v2.0.3

python3 setup.py install

三、软件验证：

cuteSV --version