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Gromacs-2025版本使用贾维斯工具完成一键编译部署

Gromacs-2025版本使用贾维斯工具完成一键编译部署

案例分享安装部署

发表于 2025/12/18

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通过Git clone下载贾维斯工具

(1)下载基本依赖软件

yum -y install git time zlib zlib-devel gcc gcc-c++ environment-modules python python3 python3-devel python3-libs python3-pip cmake make numactl numactl-devel numactl-libs rpmdevtools wget libtirpc libtirpc-devel unzip flex tar patch glibc-devel rpcbind csh perl-XML-LibXML xorg-x11-xauth curl curl-devel libcurl-devel

(2)拉取贾维斯代码仓

git clone https://gitee.com/openeuler/hpcrunner.git

环境初始化

(1)配置环境变量进入hpcrunner目录并执行source init.sh

cd hpcrunner
source init.sh

(2)加载gromacs配置文件

./jarvis -use ./templates/gromacs/2025.3/data.gromacs.arm.cpu.config

下载gromacs软件和算例文件

执行./jarvis -d 一键下载Gromacs 2025.3分支软件及算例文件

(注:TestCase算例文件下载速度慢,可以Ctrl+C终止算例下载;终止算例下载不影响Gromacs软件编译部署,但是无法通过./jarvis -r 运行算例)

./jarvis -d

下载Gromacs软件依赖

执行./jarvis -dp 一键下载Gromacs软件依赖

./jarvis -dp

编译Gromacs

执行./jarvis -b 一键编译部署Gromacs 2025版本应用

./jarvis -b

运行算例

执行./jarvis -r 运行Gromacs软件及算例

./jarvis -r

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