移植规划数据

本章节给出AlphaFold软件在移植过程中涉及到的相关软件安装规划路径的用途及详细说明。

表1 移植规划数据

序号

软件安装规划路径

用途

说明

1

-

基础环境搭建中的各安装包安装路径。

参考《HPC解决方案 基础环境搭建指导书》中“安装规划数据”章节。

2

/path/to/python

Python的安装规划路径

这里的安装规划路径只是一个举例说明,建议部署在共享路径中。现网需要根据实际情况调整,后续章节凡是遇到安装路径的命令,都以现网实际规划的安装路径为准进行替换,不再单独说明。

4

/path/to/NVIDIA-CUDA

NVIDIA CUDA组件的安装规划路径。

5

/path/to/tensorflow

TensorFlow的安装规划路径。

6

/path/to/bazel

bazel的安装规划路径。

7

/path/to/jaxlib

jaxlib的安装规划路径。

8

/path/to/AlphaFold

AlphaFold的安装规划路径。

9

/path/to/CASE

AlphaFold的算例文件存放规划路径。

10

/usr/local/cuda-11.4

cuda的安装规划路径。