软件要求如表2所示。
项目 |
版本 |
下载地址 |
---|---|---|
CMake |
3.8.1 |
|
htslib |
1.11 |
|
bcftools |
1.11 |
|
Samtools |
1.11 |
|
BamTools |
2.5.0 |
https://github.com/pezmaster31/bamtools/archive/v2.5.0.tar.gz |
Augustus |
3.3.3 |
https://github.com/Gaius-Augustus/Augustus/archive/v3.3.3.tar.gz |
算例 |
sag178 |
http://bioinf.uni-greifswald.de/augustus/datasets/sag178.gb.gz |
操作系统要求如表3所示。