本章节给出Augustus软件在移植过程中涉及到的相关软件安装规划路径的用途及详细说明。
序号 |
软件安装规划路径 |
用途 |
说明 |
|---|---|---|---|
1 |
- |
基础环境搭建中的各安装包安装路径。 |
参考《HPC解决方案 基础环境搭建指导书》中“安装规划数据”章节。 |
2 |
/path/to/AUGUSTUS/htslib |
htslib的安装规划路径。 |
这里的安装规划路径只是一个举例说明，建议部署在共享路径中。现网需要根据实际情况调整，后续章节凡是遇到安装路径的命令，都以现网实际规划的安装路径为准进行替换，不再单独说明。 |
3 |
/path/to/AUGUSTUS/bcftools |
bcftools的安装规划路径。 |
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4 |
/path/to/AUGUSTUS/samtools |
Samtools的安装规划路径。 |
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5 |
/path/to/AUGUSTUS/cmake |
CMake的安装规划路径。 |
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6 |
/path/to/AUGUSTUS/bamtools |
BamTools的安装规划路径。 |
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7 |
/path/to/AUGUSTUS/augustus |
Augustus的安装规划路径。 |
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8 |
/path/to/AUGUSTUS/CASE |
算例放置路径。 |