- 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
- 使用SFTP工具将htslib安装包上传至服务器“/path/to/AUGUSTUS”目录。
- 执行以下命令,安装依赖。
yum install -y libcurl libcurl-devel openssl openssl-devel zlib-devel bzip2 bzip2-devel xz-devel boost-devel
- 执行以下命令,解压安装包。
cd /path/to/AUGUSTUS && tar -zxf htslib-1.11.tar.gz
- 执行以下命令,重命名并进入安装目录。
mv htslib-1.11 htslib && cd htslib
- 执行以下命令,进行配置。
autoheader
autoconf
sed -i 's/\-O2/\-O3 -march=armv8.2-a -mtune=tsv110/g' `grep -lr "\-O2" ./`
CC=`which gcc` ./configure --prefix=/path/to/AUGUSTUS/htslib
- 执行以下命令,进行编译安装。
make -j 16
make install