安装Samtools

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令，安装依赖。

   yum install -y ncurses ncurses-base ncurses-libs ncurses-devel

3. 使用SFTP工具将Samtools安装包上传至服务器“/path/to/AUGUSTUS”目录。
4. 执行以下命令，解压安装包。

   cd /path/to/AUGUSTUS && tar -zxf samtools-1.11.tar.gz

5. 执行以下命令，重命名并进入安装目录。

   mv samtools-1.11 samtools && cd samtools

6. 执行以下命令，进行配置。

   autoheader
   autoconf
   sed -i 's/\-O2/\-O3 -march=armv8.2-a -mtune=tsv110/g' `grep -lr "\-O2" ./`
   CC=`which gcc` ./configure --prefix=/path/to/AUGUSTUS/samtools

7. 执行以下命令，进行编译安装。

   make -j 16
   make install