运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令，将“data”目录下的算例拷贝到“TESTCASE”目录。

   cd /path/to/BEDTOOLS/bedtools2/data
   cp gerp.chr1.bed.gz aluY.chr1.bed.gz /path/to/TESTCASE

3. 执行以下命令，解压算例。

   cd /path/to/TESTCASE
   gzip -d gerp.chr1.bed.gz
   gzip -d aluY.chr1.bed.gz

4. 执行以下命令，输出两个文件的overlap。

   bedtools intersect -a aluY.chr1.bed -b gerp.chr1.bed

   结果示例如下图所示，则表示运行成功。