编译和安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令安装相关依赖。

   R
   install.packages("BiocManager")

   回显显示信息如下图所示。

   

3. 执行以下命令安装bioconductor-manta的依赖。

   BiocManager::install("edgeR")
   BiocManager::install("Hmisc")
   BiocManager::install("caroline")
   q()

4. 执行以下命令安装bioconductor-manta。

   cd /path/to/bioconductor-manta
   R CMD INSTALL manta_1.32.0.tar.gz

   回显显示信息如下图所示。