软件要求如表2所示。
项目 |
版本 |
下载地址 |
|---|---|---|
Bowtie2 |
2.4.1 |
https://jaist.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie2/2.4.1/bowtie2-2.4.1-source.zip |
Python3 |
3.7.0 |
|
SIMDe |
master |
|
sse2neno |
master |
https://github.com/jratcliff63367/sse2neon/archive/master.zip |
测试算例 |
chromFa.tar.gz |
http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/mm10/bigZips/chromFa.tar.gz |
操作系统要求如表3所示。