Bowtie2自建索引

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入解压后的目录。

   tar -zxvf chromFa.tar.gz

3. 执行以下命令进行重定向。

   cat *.fa > mm10.fa

4. 执行以下命令构建索引。

   bowtie2-build mm10.fa mm10