Bowtie是一种超快速，内存高效的短读比对仪，旨在将大批短的DNA序列（读段）与大基因组快速比对。
Bowtie使用Burrows-Wheeler索引对基因组进行索引，以保持其内存占用量小，对于人类基因组，该索引通常约为2.2GB（用于非配对比对）或2.9GB（用于配对末端或色彩空间比对），同时使用多个处理器以获得更高的对齐速度。
关于Bowtie的更多信息请访问Bowtie官网。
语言：C语言。
一句话描述：一种超快速，高效存储的短阅读比对仪，用于下一代测序仪的短DNA序列。
开源协议：GPL 3.0。
建议使用的版本“Bowtie 1.2.3”。