软件要求如表2所示。
项目 |
版本 |
下载地址 |
|---|---|---|
Bowtie |
1.2.3 |
|
simde |
master |
|
sse2neno |
master |
https://codeload.github.com/jratcliff63367/sse2neon/zip/master |
chromFa |
hg19 |
https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg19/bigZips/chromFa.tar.gz |
测试算例1 |
SRR742200_1.fastq |
http://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR742/SRR742200/SRR742200_1.fastq.gz |
测试算例2 |
SRR742200_2.fastq |
http://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR742/SRR742200/SRR742200_2.fastq.gz |
操作系统要求如表3所示。