获取源码

操作步骤

1. 下载如下软件包和算例文件。
   • 下载Bowtie安装包“bowtie-1.2.3.zip”。

     下载地址：https://github.com/BenLangmead/bowtie/archive/v1.2.3.zip

   • 下载simde-master安装包“simde-master.zip”。

     下载地址：https://codeload.github.com/nemequ/simde/zip/master

   • 下载sse2neon-master安装包“sse2neon-master.zip”。

     下载地址：https://codeload.github.com/jratcliff63367/sse2neon/zip/master

   • 下载人类基因组包“chromFa.tar.gz”。

     下载地址：https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg19/bigZips/chromFa.tar.gz

   • 下载SRR742200_1.fastq算例文件“SRR742200_1.fastq.gz”。

     下载地址：http://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR742/SRR742200/SRR742200_1.fastq.gz

   • 下载SRR742200_2.fastq算例文件“SRR742200_2.fastq.gz”。

     下载地址：http://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR742/SRR742200/SRR742200_2.fastq.gz

2. 使用SFTP工具将如下软件包和算例文件上传至服务器对应目录。
   • 将Bowtie安装包上传至服务器“/path/to/BOWTIE”目录。
   • 将simde-master安装包上传至服务器“/path/to/SIMDE”目录。
   • 将sse2neon-master安装包上传至服务器“/path/to/SSE2NENO”目录。
   • 将chromFa.tar.gz安装包上传至服务器“/path/to/CHROMFA”目录。
   • 将算例文件“SRR742200_1.fastq.gz”上传至服务器“/path/to/CHROMFA/man_hg19/”目录
   • 将算例文件“SRR742200_2.fastq.gz”上传至服务器“/path/to/CHROMFA/man_hg19/”目录