运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入“man_hg19”目录。

   cd /path/to/CHROMFA/man_hg19/

3. 执行以下命令解压算例文件。

   gzip -d SRR742200_1.fastq.gz
   gzip -d SRR742200_2.fastq.gz

4. 执行以下命令运行Bowtie获取“.sam”文件（需要对应的生物序列文本“xxx.fastq”）。

   bowtie -S -t -q -p 128 man_index -1 ./SRR742200_1.fastq -2 ./SRR742200_2.fastq SRR742200_out.sam

   结果样例如下图所示。