安装GeneMark

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 安装ExaGear for Server,请参考《二进制动态翻译 用户指南》中“安装ExaGear for Server on CentOS”章节。
  3. 执行以下命令安装相关依赖。

    yum install perl-CPAN
    cpan -i YAML
    cpan -i Hash::Merge
    cpan -i Logger::Simple
    cpan -i Parallel:ForkManager
    cpan -i MCE::Mutex

  4. 执行以下命令获取安装包。

    下载地址:http://exon.gatech.edu/GeneMark/license_download.cgi

    软件需填写申请后才可下载,主软件和许可证都需下载。

    1. 填写申请。

    2. 下载主软件。

    3. 下载许可证key。

  5. 执行以下命令安装软件。

    1. 进入到安装包目录。
      cd /path/to/GeneMark
    2. 解压安装包。
      tar xvf gmes_linux_64_4.tar.gz
    3. 解压许可证。
      gunzip gm_key_64
    4. 设置许可证。
      cd gmes_linux_64_4
      mv ../gmes_linux_64_4 ./.gm_key
    5. 设置环境变量。
      export PATH=/path/to/GeneMark/gmes_linux_64_4:$PATH