软件要求如表2所示。
项目 |
版本 |
下载地址 |
|---|---|---|
BWA |
0.7.17 |
https://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/bwa-0.7.17.tar.bz2 |
算例文件1 |
ERR1044518_1.fastq |
https://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/ERR104/008/ERR1044518/ERR1044518_1.fastq.gz |
算例文件2 |
ERR1044518_2.fastq |
https://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/ERR104/008/ERR1044518/ERR1044518_2.fastq.gz |
算例文件3 |
hs38DH.fasta |
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/000/001/405/GCA_000001405.15_GRCh38/seqs_for_alignment_pipelines.ucsc_ids/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna.gz（下载后用gzip -d解压后，重命名为hs38DH.fasta） |
操作系统要求如表3所示。