编译和安装

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令进入源码包目录。

    cd /path/to/featurecounts

  3. 执行以下命令解压安装包并进入解压后的目录。

    tar xvf subread-2.0.3-source.tar.gz
    cd subread-2.0.3-source

  4. 执行以下命令修改文件。

    1. 打开“Makefile.Linux”文件。
      vim src/Makefile.Linux
    2. 按“i”进入编辑模式,将第10行中“core2”改成“tsv110”。
    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。

  5. 执行以下命令修改文件。

    1. 打开“Makefile”文件。
      vim src/longread-one/Makefile
    2. 按“i”进入编辑模式,将第7行中“core2”改成“tsv110”。
    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。

  6. 执行以下命令编译安装。

    cd src
    make -f Makefile.Linux

    回显显示信息如下图所示。