编译和安装

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令安装GATK4。

    unzip gatk-4.0.0.0.zip
    export PATH=/path/to/GATK/gatk-4.0.0.0:$PATH
    gatk -help

  3. 安装部署Hadoop-Spark及启动Hadoop-Spark服务,具体步骤请参考《Hadoop 3.1.2+Spark 2.4.4 移植指南(CentOS 7.6)》中的“编译和安装”章节。