运行和验证

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令进入主程序安装目录。

    cd /path/to/homer

  3. 执行以下命令下载测试文件。

    wget https://phoenixnap.dl.sourceforge.net/project/rseqc/BED/Human_Homo_sapiens/hg19_RefSeq.bed.gz

  4. 执行以下命令解压测试文件。

    gzip -d hg19_RefSeq.bed.gz

  5. 执行以下命令进行测试。

    findMotifsGenome.pl hg19_RefSeq.bed hg19 H3K4Me3_motif -len 8,10,12

    测试执行时间需要约100分钟。

    测试结果在此目录下。