Jellyfish是一种快速、高效地计算DNA中k-mer的工具。k-mer是长度为k的子串,计算所有此类子串的出现次数是许多DNA序列分析的核心步骤。通过使用哈希表的有效编码和利用“比较和交换”CPU指令来增加并行性。
关于Jellyfish的更多信息请访问Jellyfish官网。
语言:C++。
一句话描述:Jellyfish是一种快速、高效地计算DNA中k-mer的工具。
开源协议:GPL-3.0。
建议使用的版本为“Jellyfish 2.3.0”。