运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入“CASE”目录。

   cd /path/to/CASE

3. 执行以下命令解压算例包。

   gzip -d hg38.chr4.fa.gz
   gzip -d galGal3.chr4.fa.gz

4. 执行以下命令运行用例。

   time lastz hg38.chr4.fa galGal3.chr4.fa --notransition --step=20 --nogapped --format=maf > hg38_4_vs_galGal3_4-kp7265.maf

5. 执行以下命令查看“hg38_4_vs_galGal3_4-kp7265.maf”。

   vim hg38_4_vs_galGal3_4-kp7265.maf

   输出的结果样例如图1所示。

   图1 结果样例