编译和安装

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令,安装基础依赖。

    yum install zlib perl-ExtUtils-CBuilder perl-ExtUtils-MakeMaker

  3. 执行以下命令,指定编译器。

    export CC=`which gcc`
    export CXX=`which g++`
    export FC=`which gfortran`

  4. 执行以下命令,安装SVG。

    tar -xzf SVG-2.85.tar.gz
    cd SVG-2.85
    perl Makefile.PL
    make
    make install

  5. 执行以下命令,安装LDBlockShow。

    tar -zxvf v1.36.tar.gz
    cd LDBlockShow-1.36
    chmod +x configure
    ./configure
    make
    cp LDBlockShow ./bin/
    cp: overwrite ‘./bin/LDBlockShow’? y

  6. 执行以下命令,安装PLINK。

    yum install blas-devel lapack-devel atlas-devel perl-Digest-SHA -y
    ln -s /usr/lib64/atlas/libtatlas.so.3.10 /usr/lib64/atlas/libatlas.so
    ln -s /usr/lib64/atlas/libsatlas.so.3.10 /usr/lib64/atlas/libcblas.so
    tar -zxf master.tar.gz
    mv zlib-1.2.11.tar.gz plink-ng-master
    cd plink-ng-master/1.9 && sed -i '0,/curl/s/curl/# curl/g' plink_first_compile
    ./plink_first_compile
    cp plink /path/to/LDBLOCKSHOW/LDBlockShow-1.36/bin/
    cp: overwrite ‘/path/to/LDBLOCKSHOW/LDBlockShow-1.36/bin/plink’? y