运行和验证

操作步骤

1. 执行以下命令进入测试目录。

   cd /path/to/CASE

2. 执行以下命令添加环境变量。

   export PATH=/path/to/MAFFT/bin:$PATH

3. 执行以下命令检测软件是否正确安装。

   { time MAFFT_N_THREADS_PER_PROCESS="1" MAFFT_MPIRUN="mpirun --allow-run-as-root -n 128" MAFFT_TMPDIR="/path/to/CASE" mafft --mpi --large --globalpair ex1.txt > kp_out; } 2>&1 | tee -a  `hostname`_`date '+%Y%m%d%H%M%S'`.log

   运行结果如图所示。