安装RMBlast

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令解压源码包。

    tar zxvf ncbi-rmblastn-2.2.28-src.tar.gz

  3. 执行以下命令进入解压后目录。

    cd ncbi-rmblastn-2.2.28-src

  4. 执行以下命令修改“configure”文件。

    1. 打开“configure”文件。
      vi src/build-system/configure
    2. 按“i”进入编辑模式,修改为第4749行的内容。
      4746 if test "$GCC" = "yes" ; then
      4747    compiler_ver="`$real_CXX -dumpversion 2>&1`"
      4748    case "$compiler_ver" in
      4749      2.95* | 2.96* | 3.* | 4.* | 7.*)
      4750        compiler="GCC"
      4751        ncbi_compiler="GCC"
      4752        ncbi_compiler_ver="$compiler_ver"

      执行4.a之后,按“Esc”键,输入:set nu,按“Enter”即可显示出行号。

    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。

  5. 执行以下命令编译安装。

    ./configure --prefix=/path/to/rmblas --build=aarch64-unknown-linux-gnu --without-debug --with-mt CFLAGS=-Wno-narrowing CXXFLAGS=-Wno-narrowing
    make -j
    make -j install

  6. 执行以下命令加载环境变量。

    export PATH=/path/to/rmblast/bin:$PATH