介绍

OrthoMCL是一种基于蛋白质序列相似性将蛋白质分组为直系同源组的算法。OrthoMCL-DB是一个公共数据库，允许用户浏览和查看使用OrthoMCL算法预先计算的正交同源组。该数据库的第4版包含116,536个直系同源组，这些直系同源组来自1,270,853个蛋白质，这些蛋白质来自88个真核生物基因组、16个古生菌基因组和34个细菌基因组。随着更多基因组被测序，未来版本的OrthoMCL-DB将包括更多蛋白质组。在这里，我们描述了如何使用OrthoMCL系统提供的两种不同方法将感兴趣的蛋白质分组到直系同源簇中。OrthoMCL-DB网站有一个用于上传和分组一组蛋白质序列的工具，通常代表一个蛋白质组。

关于OrthoMCL的更多信息请访问OrthoMCL官网。

语言：Perl。

一句话描述：OrthoMCL是一种基于蛋白质序列相似性将蛋白质分组为直系同源组的算法。

开源协议：GPL-3.0。