介绍

PAL2NAL是一个将蛋白质和相应DNA（或mRNA）序列的多序列比对转换为密码子比对的程序。即使输入的DNA序列与输入的蛋白质序列不匹配，或者包含UTR、polyA尾，程序也会自动分配相应的密码子序列。它还可以处理输入比对中的移码，适用于假基因的分析。得到的密码子比对可以进一步进行d_S和d_N替换率的计算。如果输入是一对序列，PAL2NAL会通过codeml程序自动计算出d_S和d_N帕米尔。

关于PAL2NAL的更多信息请访问PAL2NAL官网。

语言：Perl。

一句话描述：PAL2NAL是一个将蛋白质和相应DNA（或mRNA）序列的多序列比对转换为密码子比对的程序。

开源协议：GPL-2.0。