环境要求

CPU

鲲鹏920处理器

PASA

2.4.1

https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/archive/pasa-v2.4.1.tar.gz

URI

1.35

http://search.cpan.org/CPAN/authors/id/G/GA/GAAS/URI-1.35.tar.gz

blat

35.1

https://codeload.github.com/djhshih/blat/tar.gz/v35.1

gmap

2015-09-21

http://research-pub.gene.com/gmap/src/gmap-gsnap-2015-09-21.tar.gz

samtools

0.1.9

https://codeload.github.com/samtools/samtools/tar.gz/0.1.9

mariadb

5.5.60

CentOS 7.6镜像自带。

测试算例

genome_sample.fasta

软件自带算例。

all_transcripts.fasta.clean

all_transcripts.fasta

FL_accs.txt

CentOS

7.6

https://www.centos.org/download/

Kernel

4.14.0-115

包含在操作系统镜像中。