介绍

PBSuite:目前托管了两个由Adam English创建和维护的项目。

PBJelly:基因组升级工具。是一个高度自动化的管道,可将长测序读取(例如PacBio RS读取或fasta格式的长454读取)与高置信度草案组装对齐。PBJelly尽可能多地填补或减少捕获的空白,以产生升级的基因组草图。

PBHoney:结构变异发现工具。是两种变异识别方法的实现,旨在利用长读取(即大于10,000bp)的高可映射性。PBHoney同时考虑了读内不一致和长读的软剪尾来识别结构变异。

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语言:Python。

一句话描述:基因组升级工具和结构变异发现工具。

开源协议:自定义开源协议。

建议的版本

建议使用的版本为“PBSuite 15.8.24”。