运行验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令设置环境变量。

   export PATH=/path/to/PLATANUS/Platanus_v1.2.4:$PATH

3. 将下载好的算例文件上传至“/path/to/PLATANUS/CASE”目录并解压。
4. 执行以下命令运行算例。

   cd /path/to/PLATANUS/CASE/Platanus_allee_test_data_180619/test_run
   platanus assemble -t 64 -tmp ./ -m 8 -o out -f ../reads/Illumina_PE500/R*.fq 2>&1 |tee out.assemble.log

   结果样例如图1所示。

   图1 结果样例