RepeatModeler是一个从头转座因子(TE)家族识别和建模包。RepeatModeler的核心是三个从头重复查找程序(RECON、RepeatScout和LtrHarvest/Ltr_retriever),它们采用互补的计算方法从序列数据中识别重复元素边界和家族关系。
关于RepeatModeler的更多信息请访问RepeatModeler官网。
语言:Perl。
一句话描述:De-Novo重复发现工具。
开源协议:自定义开源协议。
建议使用版本为“RepeatModeler 2.0.1”。