SOAPdenovo是一个新颖的适用于组装短reads的方法,能组装出类似人类基因组大小的denovo草图。该软件特地设计用来组装Illumina GA short reads,新的版本减少了在图创建时的内存消耗,解决了contig组装时的重复区域的问题,增加了scaffold组装时的覆盖度和长度,改进了gap closing,更加适用于大型基因组组装。
关于SOAPdenovo的更多信息请访问SOAPdenovo官网。
语言:C/C++。
一句话描述:用于基因组组装的软件工具。
建议使用的版本为“SOAPdenovo r241”。