编译和安装

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令安装系统的依赖包“zlib-devel”

    yum install zlib-devel -y

    Yum源为CentOS7.6镜像本地源,可自行根据需要在“/etc/yum.repos.d”路径下修改文件配置。

  3. 执行以下命令解压STAR安装包。

    tar -xvf STAR-2.7.1a.tar.gz

  4. 执行以下命令进入解压后的目录。

    cd STAR-2.7.1a
    export BLAST_TOP=`pwd`

  5. 执行以下命令修改“Makefile”文件。

    1. 打开“Makefile”文件。
      vi source/Makefile
    2. 按“i”进入编辑模式,修改如下内容。
      LDFLAGSextra ?= -flto -march=native -mcpu=tsv110
      CXXFLAGSextra ?= -flto -march=native -mcpu=tsv110
    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。

  6. 执行以下命令编译安装STAR。

    cd source
    make STAR

  7. 执行以下命令查看是否生成可执行文件。

    ll
    -rwxr-xr-x 1 root root 2018464 Aug  9 13:29 STAR

  8. 执行以下命令设置STAR环境变量。

    export PATH=/path/to/STAR/STAR-2.7.1a/source/:$PATH