安装Samtools

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 使用SFTP工具将Samtools安装包上传至服务器“/path/to/SAMTOOLS”目录。
3. 执行以下命令，解压安装包。

   cd /path/to/SAMTOOLS && tar -zxf samtools-1.11.tar.gz

4. 执行以下命令，进入安装目录。

   cd samtools-1.11

5. 执行以下命令，进行配置。

   autoheader
   autoconf
   sed -i 's/\-O2/\-O3 -march=armv8.2-a -mtune=tsv110/g' `grep -lr "\-O2" ./`
   CC=`which gcc` ./configure --prefix=/path/to/SAMTOOLS --with-htslib=/path/to/HTSLIB

6. 执行以下命令，进行编译安装。

   make -j 16
   make install