安装bwa-0.7.17

操作步骤

  1. 执行以下命令下载bwa源码包。

    cd /path/to/athena_meta/dependences
    git clone https://github.com/lh3/bwa.git

  2. 执行以下命令修改配置。

    cd bwa
    wget https://raw.githubusercontent.com/DLTcollab/sse2neon/master/sse2neon.h
    vi ksw.c

    修改30行。

    #include <emmintrin.h>

    修改后。

    #include “sse2neon.h”

  3. 执行以下命令编译安装。

    make -j

  4. 执行以下命令修改目录名。

    cd ..
    mv bwa/ bwa-0.7.17/