安装R语言

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令下载R语言源码包。

    cd /path/to/bioconductor-bubbletree
    wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.2.0.tar.gz

  3. 执行以下命令解压安装包。

    tar xvf R-4.2.0.tar.gz

  4. 执行以下命令进入R源码目录。

    cd R-4.2.0

  5. 执行以下命令使用yum安装相关依赖。

    yum install libXt-devel libX11-devel readline-devel

  6. 执行以下命令编译安装R。

    ./configure --prefix=/path/to/bioconductor-bubbletree/R_install
    make
    make install

  7. 执行以下命令加载环境变量。

    export PATH=/path/to/bioconductor-bubbletree/R_install/bin:$PATH
    export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/bioconductor-bubbletree/R_install/lib/R/library:$LD_LIBRARY_PATH

  8. (可选)若用户当前网速较慢,可执行以下命令添加R语言的镜像源。

    1. 打开“~/.Rprofile”文件。
      vim ~/.Rprofile
    2. 按“i”进入编辑模式,在文件中输入以下内容。
      options("repos"= c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
      options(BioC_mirror="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")
    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。