安装R-4.2.0

操作步骤

  1. 执行以下命令,下载R语言源码包。

    cd /path/to/GROHMM
    wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.2.0.tar.gz

  2. 执行以下命令,解压并安装。

    tar xvf R-4.2.0.tar.gz
    cd R-4.2.0
    yum install libXt-devel libX11-devel readline-devel
    ./configure --prefix=/path/to/GROHMM/R_install
    make
    make install

  3. 执行以下命令,加载环境变量。

    export PATH=/path/to/GROHMM/R_install/bin:$PATH
    export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/GROHMM/R_install/lib/R/lib:$LD_LIBRARY_PATH

  4. (可选)执行以下命令,添加R语言的镜像源。

    vim ~/.Rprofile
    添加以下内容。
    options("repos"= c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
    options(BioC_mirror="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")