介绍

multiHiCcompare提供在多个Hi-C数据集中进行联合归一化和差异检测的功能。原始HiCcompare软件包的此扩展现在允许进行超过2组和每组多个样本的Hi-C实验。multiHiCcompare以稀疏上三角矩阵的形式对处理过的Hi-C数据进行操作。它接受四列（染色体、区域1、区域2、IF）制表符分隔的文本文件，存储染色质相互作用矩阵。multiHiCcompare提供适用于联合归一化Hi-C数据的loess拟合或局部加权回归（fastlo）方法。此外，它提供了一个通用线性模型（GLM）框架，该框架适用于edgeR包，以依赖于距离的方式检测Hi-C数据的差异。

关于multiHiCcompare的更多信息请访问官方网站。

开发语言：R。

一句话描述：通用线性模型（GLM）框架。

开源协议：自定义开源。