操作步骤

执行以下命令解压安装包。

cd /path/to/interproscan
tar xf interproscan-5.53-87.0-64-bit.tar.gz
cd interproscan-5.53-87.0

执行以下命令修改interproscan.properties文件下hmmer的执行文件路径。
```
vim interproscan.properties
```
修改内容如下图：

图中"/to/path/"为举例举例，以hmmer实际安装的路径为准。

执行以下命令创建去重脚本，用于修复“sfld.hmm”中NAME值不唯一的异常。

cd data/sfld/4

echo '
from collections import defaultdict

input_file = "sfld.hmm"
output_file = "sfld_fixed.hmm"

name_count = defaultdict(int)

with open(input_file, "r") as fin, open(output_file, "w") as fout:
    for line in fin:
        if line.startswith("NAME"):
            parts = line.strip().split(maxsplit=1)
            if len(parts) == 2:
                base_name = parts[1]
                name_count[base_name] += 1
                if name_count[base_name] > 1:
                    new_name = f"{base_name}_{name_count[base_name]}"
                    fout.write(f"NAME  {new_name}\n")
                else:
                    fout.write(line)
            else:
                fout.write(line)
        else:
            fout.write(line)

print(f"重复名字已修复，输出文件为：{output_file}")
' > trim.py

python3 trim.py
mv sfld.hmm sfld.hmm_bak
mv sfld_fixed.hmm sfld.hmm
cd -

执行以下命令安装。
```
sh ./interproscan.sh
```
结果回显如下，出现图中信息则为安装成功。

编译和安装

操作步骤