介绍

MetaVelvet是专为短读测序程序(例如Solexa或454)设计的从头基因组的组装器,由欧洲生物学信息研究所(EMBL-EBI)的Daniel Zerbino和Ewan Birney开发,支持多个文库的数据同时使用。而MetaVelvet基本思想是首先将由混合短读取构建的图分解为单独的子图,然后基于每个分解的子图作为孤立的物种基因组构建支架。MetaVelvet已被证明在应用于宏基因组序列时生成比Velvet更长的N50和更高质量的组装,并被公认为该研究界常用的宏基因组的组装器之一。

开发语言:C语言。

一句话描述:一款常用的基因组拼接软件,常用于二代测序数据的处理,具备很好的拼接完整性。

开源协议:GPL 3.0。

使用开源软件时需遵守开源软件的许可协议。

建议的版本

建议使用版本“MetaVelvet 1.2.01”。