介绍

mothur是由密歇根大学微生物学和免疫学系的Patrick-Schloss教授和其研究小组开发的一款开源、可扩展的软件,可用于生物信息学中的微生物生态群落分析。2009年2月发布了mothur第一个版本,现已更新至V1.48。

mothur整合了dotur、sons、treeclimber、s-libshuff、unifrac等功能,可用于形成OTU/ASV,计算生物多样性指数。目前,mothur能够处理各种测序平台产生的序列数据,具体包括:454个焦磷酸测序,llumina公司的HiSeq和MiSeq,Sanger测序法,以及PacBio和IonTorrent等代表的三代测序技术。

关于mothur的更多信息请访问mothur官网

开发语言:C++。

一句话描述:微生物生态群落分析工具。

开源协议:自定义开源协议。

使用开源软件时需遵守开源软件的许可协议。

建议的版本

建议使用版本为“mothur-1.48”。