安装velvet

操作步骤

  1. 执行以下命令下载安装包。

    cd /path/to
    wget https://codeload.github.com/dzerbino/velvet/tar.gz/v1.2.10 -O velvet-1.2.10.tar.gz

  2. 执行以下命令解压安装包并安装。

    tar xvf velvet-1.2.10.tar.gz
    cd velvet-1.2.10
    export OMP_NUM_THREADS=96
    export OMP_THREAD_LIMIT=95
    sed -ri 's/\-m64/\-mabi=lp64/g' Makefile
    make 'GATEGORIES=10' 'MAXKMERLENGTH=57' 'LONGSEQUENCES=1' 'OPENMP=1' 'BUNDLEDZLIB=1'

  3. 执行以下命令设置环境变量。

    export PATH=/path/to/velvet-1.2.10:$PATH