运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入运行目录。

   cd /path/to/CASE

3. 执行以下命令下载算例。

   wget http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/phase3/data/HG00100/alignment/HG00100.chrom20.ILLUMINA.bwa.GBR.low_coverage.20130415.bam

4. 执行以下命令测试。

   time sambamba-0.8.2 sort HG00100.chrom20.ILLUMINA.bwa.GBR.low_coverage.20130415.bam

   需要查看“real”数值，单位是s，数值越低表示性能越好。