运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令创建并进入工作路径。

   mkdir -p /path/to/CASE
   cd /path/to/CASE

3. 准备测试算例“vasp-small.gz”，并且将其拷贝至“/path/to/CASE”目录。
4. 执行以下命令部署测试算例。

   cd /path/to/CASE
   tar -vxf vasp-small.gz
   cd vasp.Hg
   mv IN-long INCAR

5. 执行以下命令设置环境的配置。

   export PATH=/path/to/VASP/vasp.5.4.4/bin:$PATH

6. 执行以下命令创建“host”文件。

   vi hostfile

7. 按“i”进入编辑模式，新增如下内容。

   node1
   node2

   

   node1和node2为运行代码的节点名称，依照实际情况修改，并保证节点相互可以Ping通。注意多台机器间的SSH免密登录。

8. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
9. 执行以下命令运行VASP程序。
   • 多节点

     mpirun --allow-run-as-root -np 16 -N 8 -x OMP_NUM_THREADS=1 -x PATH=$PATH -x LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH --hostfile hostfile vasp_std 2>&1 | tee -a vasp.out

     当VASP生成的日志“OUTCAR”的结尾处出现如下图所示内容时，表示VASP程序运行正常结束。

     

   • 单节点

     mpirun --allow-run-as-root -np 16 -x OMP_NUM_THREADS=1 vasp_std 2>&1 | tee -a vasp.out

     当VASP生成的日志“OUTCAR”的结尾处出现如下图所示内容时，表示VASP程序运行正常结束。

     

     

     • -np参数为使用的总进程数。-N为每个节点运行的进程数，这里以两节点为例。可根据机器配置进行调整。也可以不用指定这两个参数，机器会默认使用最大进程运行。
     • -x OMP_NUM_THREADS参数为指定使用的线程数。
     • 需要查看“OUTCAR”日志中的“real time”数值，单位是“s”，数值越少性能越优。