安装Samtools

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令解压Samtools安装包。

    tar -xvf samtools-1.10.tar.bz2

  3. 执行以下命令进入解压后的目录。

    cd samtools-1.10

  4. 执行以下命令进行安装。

    yum install -y bzip2-devel bzip2-libs bzip2

  5. 执行以下命令进行配置。

    ./configure --prefix=/path/to/SAMTOOLS

  6. 执行以下命令进行编译安装。

    make all all-htslib
    make install install-htslib

  7. 执行以下命令设置Samtools的环境变量。

    export PATH=/path/to/SAMTOOLS/bin:$PATH
    export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/SAMTOOLS/lib:$LD_LIBRARY_PATH